就在馬偕醫院董事會即將卸任前夕，金額超過22億元的新竹市馬偕兒童醫院BOT工程統包案，卻在10月29日公告第2次招標，並訂於11月9日開標，備標時間僅12天，比起第1次招標的40天要短了很多。不少有意投標的廠商抱怨，要在這麼短的時間設計規劃、估算、詢價，根本來不及。
本刊調查，新竹市馬偕兒童醫院BOT工程統包案，第1次招標是在9月7日公告、10月16日開標，但當時馬偕醫院董事長之爭尚未落幕，且新竹市馬偕兒童醫院的容積率到底是新竹市政府說的250%，還是馬偕醫院希望的450%，一直沒有定論，也許是變數太多，最後投標廠商不足，只能宣布流標。
另一方面，今年4月，新竹市政府函文馬偕醫院要求5月4日前辦妥地上權設定簽約，以利後續工程進行，但馬偕卻以「正辦理變更法人登記為由」拖到現在仍未簽約。
一名馬偕醫院董事說：「董事會已在看守期間，不應再有任何發包動作，最好等新的董事、董事長選出之後，針對兒童醫院容積率與新竹市政府達成共識，並完成地上權設定權，再行重啟招標程序，才符合馬偕的最佳利益。」
另名馬偕董事吳千住9月接受媒體訪問時也質疑，兒童醫院BOT案第1次發包時，以450%的容積率為計算基礎，使總預算至少多出8億元，不僅有「浮編預算」的弊端，還要負擔違約賠償的風險。
由於新竹市兒童醫院是現任市長林智堅的重要政績，如今大選將至，兒童醫院工程卻遲遲沒有進度，是否對林爭取連任的選情造成衝擊？值得關注。
對此，馬偕醫院「新」董事長蔡國明解釋，因為「舊」董事長劉伯恩提出假處分，才讓法人代表變更程序卡住，新竹市政府能夠理解。至於兒童醫院容積率雖以250%與新竹市府簽約，但不符效益，才申請改以450%的容積率興建。
