翁啟惠2年多前遭檢舉在浩鼎公司公布新藥解盲失敗當天出脫持股，涉嫌內線交易罪嫌，雖然檢方最後認定他沒有直接參與新藥臨床試驗，聽從證券營業員建議才賣股，給予不起訴，但翁啟惠持股及賣股過程仍備受質疑，也是不爭的事實，當初媒體報導並未加油添醋，或捕風捉影，無罪不代表翁沒說謊。
尤其翁啟惠瓜田李下，在2015年8月曾參加浩鼎專家會議，得知驗惡化人數未達標準，隔年在解盲前一天出售10張浩鼎股票，檢方大陣仗調查，傳喚阮姓證券營業員作證，發現阮在2016年2月18日打電話給翁啟惠時提到，「院長，浩鼎2月21日會解盲，最新消息出來後，浩鼎的股價今天有漲超過700元，我們有需要先出一點嗎？還是等下禮拜一再看，因為700塊的話還不錯，剛好也是一個整數，如果你覺得還OK，是不是要出？」
翁啟惠講完電話後，出售10張浩鼎股票，但翁啟惠在案發時，對於持股遮遮掩掩，否認利用女兒當人頭，也不承認持有上市櫃生技股票，後來證據攤開，才知翁啟惠說謊，各種排山倒海逼退聲浪才蔓延。
如今翁啟惠無罪確定，但這只是法律上的評價，並不代表翁啟惠的行為沒有爭議，攤開檢方起訴書、不起訴書及法院判決書等資料一看，讓人記憶猶新的是，翁啟惠的女兒翁郁琇一度列名浩鼎第10大股東，她從潤泰集團大老闆尹衍樑手中以每股31元取得3000張股票，還曾出脫一部分持股。
2014年間，根據浩鼎公開說明書顯示，翁郁琇持有浩鼎股票1933張，正當浩鼎案炒得沸沸揚揚之際，以浩鼎在2016年3月中均價430元計算，翁郁秀持有浩鼎已超過8億元。
試問以翁郁琇當時年僅39歲，只是位畫家，翁啟惠還曾在2012年9月時，宣稱女兒只是「窮畫家」，一副沒錢苦哈哈模樣，怎會突然拿出近億元買下3000張浩鼎股票。
司法實務上，就算翁啟惠不曾具中研院長或參與浩鼎專家會議身分，檢調偵辦一般的證交法內線交易案，本來就會全面清查異常買賣股票紀錄，翁啟惠說謊在先，加上持股及賣股的事證全都攤在眼前，難道要檢調裝瞎，當作沒看到不出手徹查嗎？
翁啟惠獲判無罪，是因合議庭認為，我國貪污罪的構成要件必須在「職務上行為」「關於不違背職務行為」的對價關係上，雙方要達到意思一致，這只是法律上的評價或見解，但仍不改變翁啟惠偷偷利用女兒當人頭、持有生技股票，對外說沒有買股的謊言。
如今翁啟惠的無罪判決效應開始蔓延，連日來，網路上突然出現一股力挺翁啟惠的聲音，直指檢方起訴草率，不顧司法人權，甚至還大肆批評媒體當時報導捕風捉影，形同霸凌式的輿論公審，偏偏翁啟惠在宣判前大打哀兵姿態，接受媒體專訪大喊無罪，如今無罪卻又出現高調攻擊司法及媒體言論，諸多巧合，不禁讓人覺得翁啟惠是得了便宜還賣乖。
翁啟惠身為中研院前院長，在案發時說謊，未如實揭露自己以女兒名義持有浩鼎公司3千張股票，還發新聞稿強調自己從未持有任何上市、上櫃及未上市的生技公司股票，不只嚴重影響民眾對他個人以及政府的信賴，翁啟惠沒有誠實申報財產，也已違反公職人員財產申報法。
最關鍵的是，媒體當時都依照事實報導，瞎掰鬼扯的反而是翁啟惠本人，至今也沒見到她女兒返台公開說明此事，翁啟惠既已無罪，若在此時又一昧想方設法，想討回昔日說謊的名譽，勢必引起民意反撲，小心得不償失。
