陳水扁說，他第一時間獲知消息就鎖定電視機螢幕，不敢離開，忐忑心情隨著媒體報導起伏不定，內心默禱機上人員能夠全部平安。直到中午11點多，空軍司令在記者會說飛機可能情況不是很好，督察長也說還有部分人員困在機身殘骸裡，「直覺災情可能不妙」。
陳水扁肯定蔡總統做了正確危機處理，立即停止所有選務與政務行程。陳指出，接下來一定會有很多陰謀論或不實謠言，為發選舉災難財不惜在傷口撒鹽。
他呼籲，藍綠陣營誰也別想利用這個不幸事件，來謀取選舉利益。他舉例，韓國瑜為贏得大選在宋楚瑜面前扯到宋妻陳萬水，也瞎掰邱義仁一手主導319槍擊案打到阿扁，都是在傷口上撒鹽，「這次黑鷹傷口流血不止，可不要再撒鹽了！」
