林昶佐向媒體發言時表示，先前疫情爆發時就與陳時中等人建議希望可以進駐指揮所，今天終於進駐了，「我是覺得已經慢了啦」，直指柯文哲說的東西都是防疫常識，「有些人聽起來可能覺得甚至是廢話」，語氣一度相當激動，直批柯文哲「現在還不是終於做PCR了！」。
柯文哲聽見林的批評，當下拿起麥克風準備回應，但這時一旁的市場自治會長直接搶走柯文哲手中的麥克風，反嗆林昶佐「疫情期間你來過幾次？只會吐槽！騙誰啊！」「我還挺你欸！你選舉來幾次？疫情來幾次？蛤！」讓林昶佐一臉尷尬，雖一度打算回話，卻被一旁的農委會主委陳吉仲接過麥克風打圓場，制止林昶佐繼續回應。
事後林昶佐在視察時，更被現場攤商怒轟「滾！」認為他身為萬華區立委，卻在疫情期間沒有關心過環南市場，也不替他們發聲，要他「回去唱歌啦！」林會長受訪時也表示，雖然他跟林昶佐是好朋友，但是疫情期間他只打過一次電話，關心有沒有疫苗，其他都沒有什麼表示，痛批林昶佐只是在作秀，也強調自己不管政治，不管誰當家他們只求經濟好。
針對這波衝突，林昶佐稍早在臉書致歉，對於他在記者會中難掩不耐的發言，向所有市民朋友表達誠摯的歉意。林昶佐解釋，柯文哲先前因為批發市場人流複雜，所以一開始不做PCR全面篩檢，所以他才會在發言時忍不住在市長面前表示，「一開始不做PCR篩檢，現在不就還是要PCR全面篩檢？請市長不要再講廢話。」
林昶佐也向現場對他表達不滿的自治會長及攤商表達歉意，「環南的各位頭家辛苦了」，並稱自疫情爆發以來，他與農委會向中央溝通批發市場優先接種疫苗，也爭取防疫及紓困政策、協助攤商及周邊鄰里處理許多緊急案件，現在批發市場的生意因為疫情嚴峻受到影響，如何讓大家儘速有效克服疫情、恢復正常工作，是從政者不可迴避的責任。
（取自林昶佐臉書）
