陳雪生無預警宣布交通委員會暫停審查預算，不久後教育文化委員會的科技部預算審查，同樣也審到一半就突然散會，讓其他朝野一陣錯愕，就連現場的國民黨召委也表示不清楚細節。隨後國民黨團總召費鴻泰召開記者會指出，行政院在公投案中「行政不中立」，刊登廣告為公投議題宣傳，利用人民的納稅錢、國家公帑大做廣告，帶頭違反《行政中立法》，因此國民黨團即刻起「全面停審111年度中央政府總預算」，直到行政院長蘇貞昌向全民公開道歉為止。
對此，政院發言人羅秉成出面重申，12月18日登場的4項公投案當中，行政院依法是反方當事人，本來就有責任向人民報告政府不同意4個公投案的立場與政策，並沒有違反行政中立法的疑義，且銓敘部早就在5月12日發布新聞稿說明：「行政機關對於公民投票案所涉及之重大政策，基於政策推動的權責，本有義務對外說明並辯護政策立場，適時澄清相關資訊。因此，公務人員受指派代表機關表達行政機關政策立場，是基於法規要求履行其職務，並無違法之處。」
羅秉成批國民黨罔顧法令解釋，惡意曲解《行政中立法》之規定，片面宣布停審預算，阻礙各項預算審查，將嚴重影響國家發展，恐將延宕明年軍公教調薪權益，各項福利政策如育兒津貼、長照補助等經費也都將受到影響，他們呼籲立委應妥為行使憲法賦予的預算審查權責，對於無謂的政治操作，行政院深表遺憾。
民進黨發言人周江杰也批國民黨，自己提了公投還不准行政機關辯護，行政機關作為公投提案的關係人，本來就有說明政策之責任，反酸國民黨說不贏行政院就翻桌拒審預算，代表他們就是要搗亂台灣。周江杰強調，請國民黨不要以不實的指控來抹黑、阻擋行政部門為政策說明，「這是剝奪人民知的權利」，喊話國民黨不要挾持國家人民的利益作為政治鬥爭的工具。
