因應本土疫情升溫，Covid-19確診個案急速增加，為避免醫院篩檢站與急診人潮過多增加群聚感染風險，並保留醫院量能，台北市長柯文哲下令各公費篩檢站迅速轉型為快篩陽綠色通道，同時提供篩檢、醫生評估診療、開立藥物等多項服務，部分站點更結合車來速篩檢站功能，民眾完全免下車即可完成篩檢到拿藥之所有醫療服務。
4月30日中興聯合院區率先整備完成，提供防疫急門診服務，5月1日台北市立聯合醫院、萬芳醫院、關渡醫院，5月3日三軍總醫院及馬偕醫院，5月4日榮民總醫院陸續響應加入。此外，聯醫與新光醫院共同合作「北士科車來速」，方便自駕或摩托車快篩陽個案前來篩檢，自5月4日起每天從上午8點至晚上8點3個時段，可服務1,200位個案。北市共有11家醫院提供防疫急門診服務。
「防疫急門診」專供快篩陽性者採預約或隨到隨做PCR採檢，有醫療需求者，可由防疫急門診醫師診療後開立藥物使用；若民眾有發燒、喉嚨痛、咳嗽、流鼻水等症狀請先快篩再就醫，如檢測結果為陽性時，請配合以下事項：
- 請將使用過的快篩陽性試劑密封，帶至台北市快篩陽篩檢站採檢PCR。
- 請攜帶健保卡。
- 請全程配戴口罩，勿搭乘大眾交通工具，由同住親友接送或自行步行、駕/騎車前往。
- 若出現喘、呼吸困難、持續胸痛、胸悶、意識不清、皮膚或嘴唇或指甲床發青等症狀，請撥119。
如無相關症狀或檢測結果為陰性，仍請遵循中央流行疫情指揮中心防疫規範，做好個人防護，持續自我健康監測。提醒一般無症狀民眾請勿前往社區採檢站或急診，避免造成交叉感染。
