行政院長蘇貞昌與相關部會首長列席接受立法院會質詢，民進黨立委王美惠關心目前相關防疫規範能否進一步鬆綁，包含運作近3年的指揮中心記者會，是否可於10月13日後不再頻繁、每天召開？蘇貞昌回應，感謝國人的支持與指揮中心986天來的打拼，如今疫情來到最後階段，好像一個隧道已看到前面的光線。
面對王美惠建議鬆綁防疫措施，蘇貞昌表示，開放的事項仍以指揮中心宣告為準，疫情仍在觀察中，已到最後階段；至於指揮中心之所以召開記者會，是因為國人想第一時間知道最新發展與規範，相關做法透明且公開，未來疫情若沒那麼緊急，指揮中心也可放鬆一些。
薛瑞元答詢時稱，疫情特別條例還在有效期限內，尚有許多事情需要銜接，因為是指揮中心命令下去執行「要收尾」；民眾黨立委賴香伶詢問，特別條例於明年6月30日還存在，而指揮中心是否就要存到那時？薛瑞元回應「是」，而指揮官是由行政院指派，因此是否降到哪一級還是由院長決定。
有媒體於疫情記者會提及薛瑞元說詞，詢問指揮中心將設置道明年6月底是否屬實？王必勝回應，指揮中心由行政院宣布成立，因此未來要解除也由行政院決定，當然指揮中心退場除了解散外，也有可能會降級開設，會從4點情況做決定。
王必勝說明，首先要視疫情狀況，包含確診及中重症案例；第二為有無更具威脅性的變種病毒；第三是COVID-19疫情流感化程度，是否已可以放心；最後則是疫情工作常態化，相關作為可如流感般常態進行。屆時達成這些條件，應該就可降級或解散，時間則要視實際狀況來決定。
