羅一鈞指出，今日無較兒少或特殊的重症、病歿個案；此外，目前重複感染已累計通報3萬110例個案，兩次發病日相距不到30天的有635例、約占2.1%，為使重複感染個案能獲得更妥善處置，專家會議討論後，決定可多採認14天至1個月發病個案，未來經醫師通報疑為重複感染，就會自動通報為確診。
羅一鈞提及，該項新制已於9月30日發布公文，除了放寬日數認定外，同時也將「症狀惡化」解釋得更清楚，並將原規定的3個月後Ct值須小於30條件刪除，僅需經PCR或抗原/核酸快篩陽性就可認定。羅一鈞表示，目前推估30天內會有重複感染的個案情形不會很多，未來放寬比例可能會增加一點；至於14天內的個案，則目前在專家會議討論後並不太認定為重複感染。
指揮中心修訂COVID-19重複感染定義與處置
一、COVID-19重複感染定義及處置：
- 距前一次發病日或採檢日14天起至3個月內，如原慢性症狀惡化、或出現發燒或有新呼吸道症狀，且SARS-CoV-2 RT-PCR檢驗陽性且Ct值<27或抗原/核酸快篩陽性，並經臨床醫師診斷為「重複感染」者。此對象經通報後即依現行確診病例處理原則，啟動相關防疫措施及醫療處置。
- 距前一次發病日或採檢日3個月以上，SARS-CoV-2 RT-PCR檢驗陽性或抗原/核酸快篩陽性者，原則視為新感染個案，依現行確診病例處理原則，啟動相關防疫措施及醫療處置。惟此類對像如經醫師綜合評估(例如目前有無疑似症狀、接觸史、旅遊史、快篩檢驗結果、SARS-CoV-2 RT-PCR 檢驗結果陽性惟Ct值≥30等)非屬新感染個案，則排除確診。
二、距前一次發病日起14天內，SARS-CoV-2 RT-PCR檢驗陽性或抗原/核酸快篩陽性者，原則視為同一病程。
三、重複感染個案如有採集PCR陽性檢體，衛生單位或臨床醫師可評估送衛生福利部疾病管制署檢驗及疫苗研製中心進行基因定序，以持續國內監測SARS-CoV-2變異株流行現況。
四、為促進用藥時效，重複感染個案於研判確定後，可由診斷之臨床醫師逕行依專業用藥，惟若臨床醫師、衛生機關或各區傳染病防治網區之正、副指揮官對於用藥時機有疑義時，可依網區指揮官指示修正。
針對變種病毒，羅一鈞表示，國內新增201例Omicron亞型變異株確定病例，分別為93例本土個案（74例BA.5、19例BA.2）及108例境外移入；而74例BA.5本土個案為年齡介於未滿5歲至90多歲的34男40女，分布為北部44例、中部18例、南部23例、東部8例，占上週所有已定序93例的79.6%；羅一鈞指出，仍有2成為BA.2但會被BA.5慢慢取代的趨勢是確定的。
指揮中心表示，今日新增之33,377例本土病例，為15,597例男性、17,766例女性、14例調查中；年齡介於未滿5歲至90多歲；個案分布為新北市6,782例、台中市4,308例、桃園市3,901例、台北市3,585例、高雄市3,120例、台南市2,190例、彰化縣1,739例、新竹縣1,058例、苗栗縣902例、屏東縣797例、新竹市747例、雲林縣717例、宜蘭縣705例、南投縣568例、基隆市504例、花蓮縣498例、嘉義縣494例、嘉義市295例、台東縣201例、澎湖縣131例、金門縣116例、連江縣19例。
指揮中心指出，今日新增38例本土病例死亡個案，為22例男性、16例女性，年齡介於50多歲至90多歲以上，皆屬重度感染、36例具慢性病史、27例未接種3劑以上COVID-19疫苗。確診日介於9月1日至9月29日，死亡日期介於9月23日至9月30日。
指揮中心說明，今日新增54例境外移入個案中，為30例男性、24例女性，年齡介於未滿5歲至80多歲，分別自美國4例，土耳其3例，德國、新加坡、中國、越南、泰國、英國及印尼各1例移入，另40例感染國家調查中。入境日期介於今年9月2日至10月14日。
