杜特蒂上任後全心掃毒，忽略了伊斯蘭激進份子在南部崛起的威脅，伊斯蘭國（IS）的勢力早已竄入南部民答那峨，5月底，菲國政府軍和效忠伊斯蘭國的激進份子在馬拉威（Marawi）展開激戰，要奪回馬拉威的控制權。
引領馬拉威叛亂的主要有2個團體，一是伊斯蘭武裝團體阿布薩亞夫（Abu Sayyaf）和馬巫德集團（Maute Group），這2個武裝團體已宣示效忠伊斯蘭國，今年4月間，菲國政府軍和阿布薩亞夫交戰後，杜特蒂再度語不驚人死不休，說阻止激進份子的方式，就是吃了他們。
杜特蒂就曾放話：「給我一個恐怖份子，再給我鹽和醋，我會把他的肝給吃了。」但杜特蒂典型的恫嚇，這回並不管用，人口20萬的馬拉威如今已成廢墟，這場危機也成了杜特蒂領導能力的最大考驗，伊斯蘭國在菲律賓侵門踏戶，也可能威脅到整個區域安全！
