本刊掌握，8月中旬北市府邀請遠雄到市府會商，遠雄集團由董事長趙文嘉親自出席，柯文哲也出面接待，這場會議獲得重大成果，包括公安容留人數降至6萬人以內、商場變更為商辦大樓，以及盈餘達標後，一定比例上繳市府解決零權利金的問題，遠雄在這卡住大巨蛋多年的3大難題，均作出全面性的讓步，但也明確表達希望北市府能積極協助解決都審爭議，讓大巨蛋及早邁入實質復工。
馬英九市府時代，刪除合約中市府每年1％的營運權利金，且讓渡給遠雄，並降低違約金額，這項「零權利金」的不平等條款曾遭監察院糾正，列為BOT契約39項缺失之一，由於涉及圖利遠雄，雙方經多次磋商後，遠雄也在日前會談中正式回覆，未來將擬定「超額盈餘」取代爭議的權利金。
這項超額盈餘的實際方案，幾乎可以確定不是由遠雄買單，因此未來可能由新的巨蛋營運團隊與北市府共商，由於巨蛋營運期已從原來的50年，縮短到36年，預期獲利的比例勢必重新計算。
根據遠雄原始的投資企劃書，大巨蛋本體一年成本需要6億元，加上其餘4棟附屬建物的營收，園區整體計算後，超出多少營運算獲利，提撥多少給市府，都需再協商。
市府祕書長張哲揚證實，柯文哲已指示副市長鄧家基擬定草案，未來都審通過後，雙方再擬定具體回繳市府的試算方案，順勢讓爭議解套。
柯文哲上任後，羅列大巨蛋等「五大案」，並成立廉政透明委員會逐一調閱資料清查，其中大巨蛋案牽涉的弊端至今仍然未解，根據北市廉委會2015年公布的調查報告，在前市長馬英九任內招商時，原本市府與遠雄10次會議紀錄明確記載，依據大巨蛋公開招標申請須知，明訂「營運權利金由申請人自行提出，按每年營業收入百分比計收」，但在2004年9月馬英九與與趙藤雄密會30分鐘後，隔3天第11次會議就變成零權利金，引起外界質疑是否圖利遠雄。
馬英九事後出庭時強調當時只是「禮貌性拜會」，但當時與遠雄議約的財政局長李述德，仍被依《貪污治罪條例》圖利罪起訴，具體求刑10年。
