知情人士指出，陳怡2017年風光上任後，將原本任職醫院的鄭姓女助理拔擢至衛生局擔任秘書，鄭女卻開始晚歸，鄭女的丈夫原本不以為意，以為是妻子工作太忙，但夫妻感情越來越冷淡，丈夫覺得不對勁，明查暗訪後，有好心人士告訴他，鄭女不僅當陳怡的祕書，還充當司機，經常接送陳怡並出入陳家，也曾在下班後與陳怡一同外出。
2017年10月某日，鄭女回到家後，老公趁機拔下老婆座車的行車記錄器記憶卡查看，才驚覺老婆可能外遇，鄭女的老公聽完妻子與陳怡的呻吟錄音檔後，決心提告捍衛家庭，認為這樣的聲音足可證明妻子與陳怡發生性行為，因此向台南地檢署提出通姦告訴，陳怡與鄭女出庭坦承二人同車，呻吟聲也都是自己所發出，但卻異口同聲表示，二人沒有在車內性交，不涉及「性器接合」的通姦犯行。
陳怡向檢察官解釋說，當時鄭女在車內自慰，他僅在一旁陪伴，由於說法不合常理，檢察官認為可信度不高，但因沒有「性器接合」的直接證據，只能給予二人不起訴，加上通姦罪已在今年五月由大法官宣告除罪化，鄭女的老公已無法再提告通姦罪，只好改以家庭被破壞及配偶權遭侵害，提出民事訴訟求償200萬元，目前正由台南地院審理中。
陳怡受到前後兩任台南市長的倚重，雖然工作表現獲得長官高度肯定，但與女祕書發生車震曖昧情，重創形象，如今曾姓人夫已向台南市長黃偉哲陳情，接下來不僅要看法院怎麼判決，也要看市長如何處理小內閣私德的智慧了。
