另一方面，此風暴更掀起入境普篩政治戰，國民黨主席江啟臣擬串聯14執政縣市自推入境普篩卻遭自家人打臉，但綠營定調維持現行政策、不實施入境普篩。公衛專家蘇益仁則示警，10月入秋後流感漸入高峰期，是比爭辯要不要入境普篩，更須未雨綢繆的防疫大事。
彰化縣衛生局15日以「精準篩檢」為名，主動採檢自美國返台探親的無症狀少年後確診，因仍在14天居家檢疫期間，遭質疑不符中央防疫採檢規定而遭送政風調查，被認為「逆時中」的彰化縣衛生局長葉彥伯出面哽咽說：「我只是比中央多做了一些！」
「多做了這些（入境普篩），我們大概多花8億多吧，但是得到的是，讓我們的醫療步入一個崩解的道路。」事件爆發後，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中23日出面定調，目前不考慮入境普篩，更打臉葉彥伯直言，若防疫做得對，多做沒問題，但若做得有問題，多做就會有大問題。
葉彥伯自推精準篩檢惹議，不僅讓中央與地方的防疫角力浮上檯面、掀起入境普篩政治攻防戰，另也爆出葉身兼台灣篩檢學會理事長的案外案，他上任理事長後，學會多次會議都直接辦在衛生局場地，卻免付場租費，學會形同「寄生衛生局」，遭質疑有公私不分之嫌。
