歐洲疾病管制局出版的《Eurosurveillance》，6月17日刊出一篇Finlay Campbell等人的研究，該文分析了四大高關注變異株的傳播力RT值，結果發現，相較於武漢原始株，Beta（南非株）的傳播力多了25%，目前台灣最流行的Alpha（英國株）則多了29%，至於Gamma（巴西株）多了38%，而傳播力最強的就屬Delta（印度株），竟多了97%。而根據譚德塞2日的說法，Delta變異株已在至少九十八國現蹤，全球疫情處於「非常危險時期」。
台灣過去一年半以來雖有零星Delta變異株個案，但都屬境外移入。6月21日自秘魯返國的屏東祖孫因Delta變異株確診，一度讓疫情拉警報，屏東縣府隨即祭出緊急防堵措施，除要求枋山鄉楓港、善餘村二村全村篩檢並大消毒，26日更下令兩村升為「準四級」警戒，禁止所有餐廳、超商、超市等商家營業，並採家戶發放防疫物資方式應急，因圍堵策略成功，30日宣布二村解封。
儘管屏東疫情已暫時控制住，但Delta變異株因其具高度傳播性及對風險族群容易造成重症或死亡，指揮中心仍不敢掉以輕心，六月底開始陸續增強我國的入境檢疫措施及採檢規格。
指揮中心6月22日先宣布，確診個案的密切接觸者及自國外入境者，在居家隔離或居家檢疫期滿前一日，無論有無症狀均須進行PCR檢測，接著，7月2日中午12時起更祭出「三採」策略，入境旅客不管14天內有沒有「重點高風險國家」旅遊史，都須在入住時、檢疫期滿前各進行PCR檢測一次，另檢疫期間的第10至12天還須以家用快篩採檢一次，所有入境旅客只要檢驗為陽性，都要進行病毒基因定序，以確定是否受Delta變異株或其他變異株感染。
