柯文哲於廣播節目中《千秋萬事》專訪中爆料，13日開會時才得知，有一批莫德納疫苗被放到過期，痛批會有這樣的情況就是中央的疫苗政策一團亂，認為中央流行疫情指揮中心很多政策都「政治凌駕專業」。
針對過期莫德納疫苗，蔡炳坤說明，12月7日過期的莫德納，北市已如期接種完畢，但中央開設的台北車站接種站，疫苗來自包含雲林、花蓮、台東與彰化等地，送來357瓶疫苗，而一瓶14劑共可施打4,998劑。
蔡炳坤進一步表示，北車接種站負責施打的醫院為台北市內湖三總、松山三總與新北市部立醫院，7日當天負責醫院為松山三總，因此帳還是會算在台北市上，目前已知打完剩下11瓶共154劑送回中央，後續如何處理還是會尊重中央。
對於柯文哲爆料的內容，赴立法院報告備詢的陳時中則澄清，聲稱沒有任何疫苗因過期被銷毀，目前全台約有11萬劑莫德納將於12月21日前到期，中央正協助調配。指揮中心發言人莊人祥於疫情記者會也強調，屆期疫苗都已使用完畢，除了接種疫苗之外，也有可能會給實驗用動物施打，但這些量非常少。
