本刊掌握，檢調拂曉出擊搜索時，楊文科恰好準備出門參加全縣中小學運動會聖火點燃活動，他見大批專案小組登門，自認清白，一度拉高音量反問：「憑什麼搜索？」檢調出示搜索票後，楊只好配合並被帶往北機站與竹檢偵訊，直到深夜11點複訊結束被諭知交保，楊一臉不悅摃上檢察官，認為他沒有插手豐邑案，揚言不願保釋，看檢方怎麼處理，雙方一度僵持不下，偵查庭內火藥味十足，經過一陣勸說，楊才同意辦保。
隔天一早，楊即現身撇清涉及不法，國民黨也發聲明力挺，不過，外界不知檢調在大動作搜索前早就掌握5大關鍵事證，懷疑楊文科涉嫌授意工務處放水天坑案建商復工，其中存在對價關係。
知情人士透露，專案小組早在去年9月首波搜索豐邑建設，就扣到建商這2年的內帳紀錄，清楚註記2年中秋節前夕各出帳4萬元餐券，共計8萬元全流向縣府官員，加上楊文科尋求連任的竹北競選總部向豐邑承租，後來豐邑全數以政治獻金的名義回捐，金流完全相符。
此外，天坑案發生後楊文科多次受訪，都對建商放狠話，表示除了勒令停工及裁罰外，還限期建商改善，但沒多久豐邑即獲准復工，塌陷事件卻一再重演，雙方綿密的關係在地方不脛而走，加上豐邑的員工在通話中提到「縣長好像搞定了」。
此外，縣府要求建商出具第三方報告才能復工，豐邑竟涉嫌竄改桃園市結構技師公會的鑑定報告等，都讓檢調更加懷疑縣府包庇建商，全案涉及行、收賄及圖利，楊文科也遭鎖定是幕後最大藏鏡人。
