《我們與惡的距離Ⅱ》（以下簡稱《與惡Ⅱ》）總製作預算達新台幣1.6億元，是第一季的近4倍，其中5,040萬元來自文化部「匯聚台流文化黑潮—國際台劇徵案」第一梯次的補助，出品方包括文策院、公視、CATCHPLAY和大慕可可，由大慕影藝製作。
CATCHPLAY兼具投資與發行方，主導海外平台銷售的執行長楊麗貞表示，近年業界向海外推廣台劇，常見模式是高價賣給單一國際平台。她的目標是把台灣在內的部分國家或地區的版權保留在手中，同時打進海外市場，經評估後認為Amazon Prime Video是最理想的合作平台，因台灣目前並非該平台的重點市場，在台市占率不高，應該有較多的談判空間。
不過，Prime Video的亞洲布局以韓國和印度為主，搭配少數馬來語或印尼語的戲劇，從沒買過台劇。楊麗貞透過人脈聯繫該平台相關決策小組，小組成員來自歐美、印度和東南亞國家，文化背景互異，楊麗貞以他們可以理解的方式，傳達《與惡Ⅱ》的故事核心，說服對方購買，過程冗長，耗時約3個月才談成。最終由CATCHPLAY保留台灣、中港澳和韓國等地的發行權，另透過Prime Video在其他逾240個國家或地區同步上架。
楊麗貞認為，《與惡Ⅱ》的案例已打下基礎，「我們希望一炮而紅，立下成功範例，未來台劇若要在Prime Video上架，我覺得會簡單很多，不像我們這麼艱辛，從零開始說服他們。」
《與惡》系列歷時6年才推出第二季，故事主線人物來自6個家庭，由隨機縱火案和殺警兩個重大案件展開，呈現人物角色之間跨越20年的糾葛。劇本由第一季的編劇呂蒔媛撰寫，她從判決書中找靈感，經長時間田調，交出前2集劇本，卻因故事牽涉的政治題材及女性處境，近似當時大慕影藝製作中的《人選之人—造浪者》，於是全盤推翻，時隔1年才交出現今版本的前2集。
製作人林昱伶表示，《與惡Ⅱ》從重大災難事件延伸出不同面向的故事，她看到劇本3分之1的時候「就拿出小本本，開始記錄每個人的名字，因為出場人物實在太多。」導演林君陽回憶，當初拿到劇本很興奮，也有點手足無措。主要是每2集就出現時間斷代，打破某些敘事慣性，加上角色眾多且關係複雜，讓他思考該如何找到每集的核心精神，帶領觀眾理解人物和故事。
林君陽不諱言，有人建議能否少一條故事線。但他認為呂蒔媛擅長描寫人物，觀眾很容易理解每個角色的狀態，進而勾動好奇心，並對角色的處境產生共鳴。林昱伶也反對更改劇本，她相信《與惡》第一季的成功，讓撰寫續集的呂蒔媛備感壓力，同時想自我突破和挑戰，此時身為製作人的她會全力支持。
本劇的格局龐大，對製作團隊是「超過天花板的難度」。
不過林昱伶也坦言，本劇的格局龐大，對製作團隊是一大挑戰，並以「超過天花板的難度」來形容。由於時間跨度達20年，且要處理角色們同時回到10年前和20年前的時空。當中，故事人物所處的社會環境都有所變動，對製作部門而言是很複雜的過程，累積付出的時間和心力就像做了3部劇。
例如主要演員約有50人，加上近3000人次的臨演群眾，導致造型組、選角組的工作繁重。全劇拍攝足跡遍及北中南，在6個城市拼湊出107個場景，且考量到時間變遷的因素，美術組必須細緻呈現空間差異，畢竟經過20年，交通號誌、街道標示和招牌字體都有所不同，工作人員開拍前便蒐集大量資料，並透過細節堆疊出符合時代的特色。
有200顆鏡頭採用減齡視覺特效，對台劇來說是第一次。
另一個大工程是減齡視覺特效。林君陽表示，近年已有影視拍攝團隊利用後期特效處理演員臉部的變化，讓人物看起來更年輕。《與惡Ⅱ》在兩集的長度、10個角色中，合計約有200顆鏡頭採用減齡視覺特效，對台劇來說是第一次。開拍前他與後期特效公司多次討論，也參考勞勃狄尼洛主演的電影《愛爾蘭人》，甚至請負責製作該片的好萊塢特效公司報價，最後考量整體預算、時間和資源而放棄。
為了呈現角色年輕時期的模樣，現場拍攝時，演員的臉上會貼追蹤點，髮型或造型也微幅調整。另外再藉由打光，或透過拉提方式稍微改變臉形。後期特效公司則根據追蹤點調整，比方讓有些人增胖、有些人變瘦等。至於不同生命階段的氣質與心境，例如周渝民飾演的精神科醫師在前兩集狀態淒慘，待時空拉回學生時期，又散發青春洋溢氣息，就要憑演員的演技和肢體語言詮釋。
以往台劇較少編列國際行銷預算，此次《與惡Ⅱ》則投入800萬元相關經費，且楊麗貞與團隊陸續參加新加坡亞洲電視論壇及內容交易市場展、首次在台舉行的亞洲影視內容峰會（ContentAsia Summit），以及文策院舉行的TCCF創意內容大會等，透過各種機會與國內外影視產業人士交流，提高台灣作品的國際能見度。
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