《都市開基祖》製作人兼編劇陳南宏原本就想拍工人故事，也很欣賞林生祥的作品，在獲悉客家電視台「戲劇類節目電視影集」徵案後，他反覆聽抒發都市勞動者心聲的林生祥《臨暗》專輯裡的歌曲，對其中的〈都市開基祖〉特別有感。「誰是『都市開基祖』？就是工人。翻找資料時，看到九〇年代捷運潛水夫病事件新聞，忽然發現可以用『都市開基祖』將林生祥的音樂、捷運與潛水夫病等元素相互串聯。」陳南宏選定題材寫出故事大綱，順利通過徵案評選。
「我爸爸、叔叔、舅舅都是工人。我家半農半工，做泥水工、也種田，叔叔是水電工，舅舅是水泥工，我也做過泥水工，幫爸爸打散工，因此我對工人怎麼思考事情並不陌生。」陳南宏以他的背景經歷得到的感受和團隊一起撰寫劇本，同時進行田調。
當年北捷新店線因採用「壓氣工法」，也就是靠在隧道加壓方式減少地下水滲流，但施工單位未依法進行加減壓程序，導致工人集體罹患潛水夫病，受害工人也展開抗爭。為讓內容更有說服力，陳南宏透過工傷協會訪問當時罹病的7、8位工人與帶領工人抗爭的顧玉玲、開醫療證明的醫師、替勞工辯護的律師與當年北市勞工局長，另外也訪問同一時期捷運其他營造工程人員。
「訪問罹病工人時，著重了解他們的生命史，像是家庭背景、成長經歷、為何會當工人等，不會只專注在得病的過程、心情以及向主責機構抗爭的感受。」訪問一輪下來，陳南宏更全面理解事件，但罹病工人回顧的態度卻他出乎預期。「我以為談到這件事情時，他們可能會很激動、或急於透過作品替他們發聲，但其實沒有。對他們來說，那比較像生命裡的片段，坦然程度遠超過我原本想像，所以故事走向也逐步調整。」
