柯文哲指出，過去民進黨反對美豬美牛的進口，現在又說同意，中間的轉折他希望政府可以出面說明清楚，「小英自稱是最能溝通的政府，可是在這個事件，我覺得她也不是要跟大家商量，擺明了就是通知你，所以說在這個過程當中，她不是一個如她所說『最會溝通的政府』」。
柯文哲說，他不想陷入一個口水戰，去酸蔡政府什麼「髮夾彎」「昨天的小英打臉今天的小英」「雙標黨」，但身為一個行政人員，要很務實的去看，例如養豬相關的產業，包含蓋豬舍、養豬、屠宰，甚至到肉品加工，產值在台灣大概是2,000億元的金流量，但現在只有4個月的時間就要放寬進口，那到底要怎麼應變，柯文哲認為這是政府應該要交代的。
對於美豬放寬進口後的管理，柯文哲也覺得政府要做好把關和標示的工作，而不是把分辨產地的責任推給民眾，至於台北市是否會自己訂出一套規範？柯文哲笑說，他每次提出意見都被說是在「逆時中」，他強調自己還是一個科學家，也不想和中央抗爭，他希望民進黨政府統一訂出標準，先講清楚再讓他們看要怎麼處理，並重申自己不會故意要和中央對立。
對於當初國民兩黨當初都曾在不同立場攻防，如今民進黨政府也選擇開放萊克多巴胺美豬進口，柯文哲直言，他心裡真正的想問的是，「到底小英妳是換了什麼東西回來？」
衛福部長陳時中曾說，這是為了台灣的國際地位，但柯覺得這個說法太過空泛，他想知道蔡英文政府用美豬美牛換了什麼回來，「如果她能跟美國簽FTA，我當然跟她鼓掌贊成啊，問題是有嗎？我沒有看到啊？如果今天美國跟台灣簽FTA，用美豬美牛去換，我也可以接受，問題是有嗎？換了我就跟妳喝采啊，有嗎？」
柯文哲坦言這次只用行政命令就開放「有點鴨霸」，但最重要的還是蔡政府開放美豬美牛後，「妳到底換了什麼東西回來妳要講啊。」
