知情人士指出，2021年1月動工前，蕭與妻子曾拜訪鄰居陳姓屋主，當時陳向蕭君平夫婦表示，房屋很舊了，希望能先請專業人士鑑定鄰房屋況，以避免日後糾紛，蕭君平夫婦卻說：「不必鑑定，若有鄰損會負責到底。」3日後工班進駐施工，陳姓屋主指控，在對方動工不到1個月，家中就壁裂60多處，櫃中的杯子等物品也被震落毀損，此外，噪音擾人，讓已逾7旬的他與妻子難以忍受，且施工時塵土飛揚，他為了清理灰塵還從鋁梯摔落受傷，至今仍得復健。陳姓鄰居摔傷後，蕭君平的妻子簽下切結書，允諾賠償陳家損失。
陳姓鄰居原本以為蕭醫師夫婦會妥適處理此事，不料隨著工程的進行，家中共同壁遭破壞，不僅危及全棟結構安全，更逢雨必漏水，讓他與妻子一遇雨天就擔心受怕，還得忙著清理積水，後來還跳電，加上噪音越來越大，有時隔壁還會傳來大悲咒訟經聲，他與妻子無法忍受，2021年5月曾借住親友家及在外租屋1年多，回到住處後，屋損及施工噪音依舊，他和太太的身心也出現狀況，開始向身心科醫師求助，至今仍得回診，當時一歲的孫女則因被施工噪音嚇醒，瘋狂抓臉耳導致滿臉是血，讓全家都嚇壞了。
2021年7月，陳家認為屋損嚴重，經建築師鑑定後建議，要求蕭君平夫婦停止施工，遭對方拒絕，於是向高雄市政府工務局提出檢舉，指蕭君平夫婦房屋的增建，涉及違反《建築法》建請停工，高雄市政府工務局查看後認定確實為新違建，排入拆除程序，同年8月6日，陳在家門口請蕭君平處理頂樓漏水，雖然蕭答應最後會進行修繕，但仍說：「不是你講我是醫生，我全部就給你吃軟軟（台語），我們做事情要合情合理，以前我是在七逃（台語）！」鄰居認為蕭涉以自己有黑道背景恐嚇他，向高雄地檢署提告恐嚇及毀損。
陳、蕭二家自此鬧翻，蕭君平隨後也檢舉陳家後方有違法增建，並指控陳姓鄰居擅自進入他施工中的房屋拍照，侵害他人隱私且涉及無故侵入住宅罪。目前雙方的訴訟及檢舉大戰，檢察官均認為不構成犯罪，均予不起訴，違建及鄰損部份，蕭君平夫婦買入這棟房改建及增建後曾因被認定有違建而拆除，後來又復建出租，高雄市工務局接獲檢舉正查辦中，鄰損案則仍由法院審理中，風波恐一時仍難善了。
回應
本刊致電蕭君平醫師家中，其妻秦芷菁醫師表示，對違建及鄰損等指控，的確有被認定為違建而拆除，很抱歉此事浪費這麼多社會資源，她與先生從一開始就想要好好處理此事，多次與陳姓鄰居協調，很可惜雙方未達共識，目前全案進入司法程序，一切尊重司法審理，希望能圓滿解決，遭控鄰損的部分，也會遵照將來法院判決處理，但否認故意製造噪音及檢舉鄰居在騎樓停車。
