彰化地檢署主任檢察官高如應、檢察官陳顗安2年前接獲檢舉，指陳堯俐非法仲介病患到中國換肝、換腎，查出陳任職彰化基督教醫院期間，2015年7月以後共非法仲介至少9名病患到中國換肝、換腎，並向每名病患收取新台幣300萬到750萬元不等，陳個人獲利近1,500萬元。
檢方清查得知陳堯俐在彰基服務21年，之所以沒有去彰基搜索，是因陳堯俐準備轉職中山、秀傳2家醫院時，把所有病例資料全搬到秀傳、中山醫學院，最後才鎖定秀傳、中山醫學院搜索。
檢警偵辦期間，曾派人跟監陳堯俐上班、下班行程，發現他主要在台中市區、中山與秀傳這些地方活動，很少回彰化。
檢方逐一詢問陳堯俐看診過的彰基病患，發現陳在彰基就已有仲介行為，為了躲避查緝，他都利用電話或手機與仲介、病患聯繫，基本上沒有留下任何資料在彰基。檢方甚至調過陳堯俐歷年看過診的全部病例，發現病例資料上，陳堯俐刻意把病患的病歷內容省略，只有單純記錄病患從什麼時間加入、什麼時間回來，文字記錄很簡單。
儘管陳堯俐刻意把看診病歷細節全部省略掉，檢方卻發現陳一開始開刀門診病患數並不多，但術後去找他門診追蹤的人卻異常的多，台灣實施健保制度以來，健保紀錄清楚登錄每一個醫師問診的電子紀錄，檢方清查陳堯俐針對哪些病患開過抗排斥藥，從他開過的藥追蹤這些病患，查明當年在哪家醫院動刀。
檢方清查過程中，已把陳堯俐曾開過抗排斥藥物的病例全部調閱檢視一遍，但因《人體器官移植條例》在2015年7月1日前不處罰仲介行為，檢方刻意把修法前的病患省略，因為只是行政處罰罰錢，不在檢察官偵查範圍之內，只追究有刑責期間內的個案。
檢方調查主力放在2015年7月1日到新冠疫情發生前這段時間，因疫情發生後，中國就無法進去換肝。調查後，陳仲介的病患總數是35位，2015年6月30日之前有26位病患，2015年7月1日之後有9位。檢方調查過程中，發現腎臟移植的2名病患都還存活，但肝臟移植的6位中，只有1位存活，5位都已過世。
陳堯俐接受檢方問訊時，一開始坦承跟病患仲介費收100萬元，後來律師幫他改口說陳講錯了，應是收90萬元。病患匯的錢若在大陸沒用完，並沒有還給病患家屬，仲介會帶回台交給陳堯俐使用，行徑惡劣。總計陳堯俐獲利金額超過1千多萬元，因犯罪所得需要有刑事責任，故2015年之前仲介賺的錢，不會寫在起訴書內。
器官仲介案中，關鍵人物謝姓男護理師獲緩起訴，外界一譬霧水。檢方解釋，謝男主要是受陳堯俐指使，若病患有需要，才會派他去大陸教導當地護理師、護理人員進行術後照護，本身沒有參與器官仲介行為。謝在審理期間，全數繳回照顧病患得到的酬勞，幫助犯刑責較輕，才會給予緩起訴。
檢方特別解釋謝男護理師醫療背景，他在術後照顧病人技術很好，且有移植專科護理師證照，曾是彰基肝臟移植團隊1員，跟陳堯俐處理肝臟移植有20年豐富經驗，還曾發表論文，針對照顧病人引流有特殊專長，若病患狀況不好，才會派他從台灣飛去大陸照顧病患。
備受各界關注的器官移植案，在彰化地檢署主任檢察官高如應、檢察官陳顗安2年來日以繼夜偵辦下，終於水落石出，應可告慰無辜受害者在天之靈，還給他們1個遲來的公道。
