台北地檢署以貪汙等三罪起訴立委高金素梅涉貪案，並一併以共犯起訴高金姐姐及弟弟與助理等共26人，高金素梅對檢方起訴內容逐一駁斥，並指不解為何五年前救命防疫的人民義舉，竟成被起訴的依據？她還強調，「黑夜一定會結束，我們都將會是手持火把、等待黎明的守夜人！」讓她從藝人身分轉換到政治人物的過程，從號稱原民運動鬥士到兩岸窗口，政治路線大轉折也充滿外界質疑。
詎料，她在中國獲獎後，隔年即2001年，她以無黨籍身份投入政壇，首度當選山地原住民選區立法委員，並加入無黨籍立法院黨團運作，自此擔任二十多年，她自稱這些年來努力捍衛原住民的尊嚴，並促成《原住民保留地禁伐補償條例》等關鍵法案，為眾多原住民保留地所有權人爭取補償，也爭取部落的基礎建設，勤走部落、傾聽族人的聲音，確實拿到不少原民選票。
不過，高金素梅身為原住民，卻一度高喊「我們習近平」，且赴中國與中共高層會面，言行惹議。原住民族委員會副主委陳義信去年受訪時曾表示，尊重特定人士的個人立場與言論，但強調個人的言論並不能代表整個原住民族群，台灣原住民才是真正道地的主人，他同時期盼能在未來的選舉中，推選出屬於「台灣派」的原住民立法委員。
