因應武漢肺炎疫情影響，高鐵於「母親節疏運」期間前3天（5/8-5/10），所有車次一律實施全車對號座，並暫停定期票、回數票、悠遊卡/一卡通聯名卡之使用，5月11日則維持自由座服務。
目前高鐵針對進站旅客實施全面體溫量測，旅客額溫若超過37.5℃，不得搭乘高鐵，並請旅客自備口罩、全程配戴，且全線12座車站預計今（9日）全面完成醫療級紅外線體溫感測儀的裝設，將大幅提升監測效能。
同時，高鐵公司自4/5起已調整車廂服務內容，全面暫停列車上各項販售服務，並同步撤除椅背網袋內之「TLife」車上雜誌；商務車廂改為提供單獨包裝之甜鹹點心各1份及瓶裝水，並停止供應熱飲及書報雜誌。
高鐵將針對持有定期票、回數票之旅客，提供以下配套措施：
一、 定期票：原優惠效期含5/8至5/10者，將配合展延相對應天數，另再加碼展延2天優惠效期，亦即共展延5天。
二、 回數票：除同上述定期票規定，展延回數票5天優惠效期外，於4/1（含）至5/7（含）購買回數票且於5/4至7/10在效期內使用完畢者，可於2020年7月31日前，持符合優惠資格之回數票至各車站售票窗口換購同區間半價自由座車票1張（係依原勞動節的配套措施再擴大優惠適用條件）。所換購的自由座車票不可變更且限兌換當日有效，如辦理退票，原優惠資格不予返還。
