9月起連續爆發的長榮機師案及新北市幼兒園社區感染案，經基因定序確定是被喻為「最強變種病毒」的Delta變異株，讓疫情出現隱憂。中央流行疫情指揮中心指出，幼兒園群聚案的Delta病毒是國內首見、全新的病毒序列，與6月在屏東枋山首度驗出的Delta個案、9月初的長榮機師案都不同，甚至也與目前境外移入個案的Delta病毒序列不一樣，顯見新北幼兒園案不是過去本土或境外移入病例所導致。
面對Delta入侵，指揮中心指揮官陳時中近日表示，不會因此調整疫苗接種策略，目標還是衝高第1劑的覆蓋率，第2劑的施打間隔雖有延長，但還是有保留讓大家來打。但本刊調查，英、美乃至台灣鄰近國家，甚至曾被認為防疫優等生的以色列、新加坡等國，1、2劑施打率的差距都控制在2成左右、甚至更低；相較之下台灣施打第1劑的人口涵蓋率雖近5成，已施打2劑的卻僅約4％。
公衛專家示警，一旦Delta在台爆發大規模疫情，高齡者等高危險族群若沒有完整保護力，恐致住院及重症率提高、衝擊醫療量能，直言台灣的疫苗施打策略有必要修正。
本刊調查全球疫苗施打狀況發現，美國施打1、2劑的人口差距一路都維持在1成左右；英國一開始雖全力衝刺第1劑施打率，但今年3月中下旬施打率破4成後，第2劑施打的人口就開始加速成長，第1劑達6成施打率時，第2劑施打率已破4成，如今1、2劑的落差都在1成以內；鄰近國家如日本，1、2劑施打率的差距也都控制在1成上下，韓國則是2成左右。
至於前階段與台灣同被視為防疫模範生的國家，1、2劑施打率的落差也都控制在約2成，例如新加坡1、2劑施打率的差距最多僅2成，目前第2劑施打人口甚至幾近追平第1劑；近期同遭Delta入侵的紐西蘭，當第1劑施打人口近3成5時，第2劑施打率已破2成；全球第一個施打第3劑的以色列，當初也是在第1劑施打率達2成後，第2劑人口即迅速成長，如今差距縮小在5％左右。
對此，指揮中心發言人莊人祥接受本刊採訪表示，目前疫苗施打策略仍是第1劑優先，一是因目前社區沒有大規模疫情流行，二是擔心疫苗接種間隔太短反而降低保護力，但只要有足夠的疫苗進來，就會隨時開放符合資格的對象施打第2劑，例如9月15日起開放施打的對象，除了18至22歲年輕人外，也開放打完第1劑AZ滿10週的民眾，包括65歲以上長者、洗腎患者及機構對象等高危險族群，未來疫苗陸續到貨，符合1、2劑施打間隔的對象，都會開放施打。
