檢警調查指出，該起事件源於雲林一名李姓個體戶飼養的母羊於7月初難產死亡，隨後被載運至雲林縣肉品市場屠宰，不料卻被食藥署監測專案攔截，驗出戴奧辛含量嚴重超出法定標準。為順利送宰，李男涉嫌未經授權，自行「借用」雲農畜牧場的名義填寫「家畜健康聲明書」。
雲林地檢署接獲情資後隨即成立專案小組，指揮警方與農業處等單位前往李男養殖處進行搜索，並傳喚李男、雲農畜牧場負責人及當初將羊隻賣給李男的年邁婦人到案。檢方複訊後認為李男涉嫌偽造文書罪證明確，但無羈押必要，諭知以3萬元交保，其餘關係人則訊後請回。
面對戴奧辛污染源頭，李姓飼主供稱養羊多作為觀賞用途，這次超標羊隻是4、5個月前向一名無力繼續飼養的婦人購入，平時餵食的牧草多是在野外隨機採集，造成主管機關溯源困難。由於戴奧辛屬環境荷爾蒙，長期攝入恐增加罹癌與內分泌失調風險，相關單位正進一步釐清污染究竟來自飼料、土壤還是環境野草。
雲林縣農業處則強調，該養殖場非專業屠宰場，平時並無常態性販售肉品行為，同場剩餘的8隻羊已全數進行移動管制並預防性撲殺，確定問題肉品並未流入市面消費市場，民眾無須過度恐慌。檢方後續也將調閱歷史資料，深入追查李男過去是否還有其他冒用合格聲明書出貨的違法情事。
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