《三部曲》以400年前的台灣為背景，是魏德聖醞釀20年的電影計畫，其中包含五部電影以及「豐盛之城」園區，總預算高達新台幣135億元，5部電影製作費約45億元，是台灣影史最高規格。
花谷先前雖接觸了好萊塢劇組，但主要負責與日本相關的美術工作。《三部曲》講的是台灣歷史，「在日本完全沒學過台灣歷史，甚至連荷蘭為何會在台灣歷史中出現我也不清楚，只能從頭學起。」
勇於挑戰的他接下工作後，透過網路資料、圖書館借書學習台灣歷史，也委託台灣工作人員寄書給他。其後他飛來台灣勘景，「我請他們帶我去看很多老街，包含澎湖、金門，看了很多閩南式建築，也請大學教授幫忙解說。」
回到日本後，他親自走訪長崎縣平戶和出島，由於當地曾和荷蘭有密切貿易關係，花谷特地去看後來重新搭建的貿易商館、歷史建築等作為參考。掌握資訊後，開始繪圖構思設計，每周定期和台灣開一次視訊會議討論，《三部曲》中的場景也逐漸成形。
去年7月，他在新冠肺炎疫情下從日本帶著4位助理來台長住，結束14天居家檢疫後投入搭景工作，而在台灣負責美術的團隊有20多人，依《三部曲》中3種主要族群的觀點，分成西拉雅組、荷蘭組、漢人組作業。為了全心投入，他婉拒期間接到的日本電影邀約。
在《追殺比爾》劇組時，花谷搭景時得向好萊塢及中國工作人員說明日本建築的風格與特色，但這回《三部曲》換他「入境隨俗」。他解釋：「我是要接受指導的那一方，所以我把模樣設計出來後，再請台灣團隊幫忙調整。《三部曲》是要讓台灣人看完後能更了解台灣歷史的作品，比起用日本人的角度，盡可能和台灣人站在同一角度去做，會更合適。」
