哇哇科技執行長戴丞峰分析，Switch玩家以15至30歲為大宗，其中20到30歲的族群最願意花錢買遊戲，「如果要讓遊戲賺錢，應該鎖定這族群。」但《妖果小學堂》目標觀眾為3到6歲的學齡前兒童，所以《臺灣妖果：序章》的玩法設計、故事安排也經過折衷，設定玩家為5到12歲、約為國小階段的兒童。
由於遊戲比動畫早一步推出，避免劇透又是一大挑戰。《臺灣妖果：序章》約花2、3個月撰寫遊戲腳本，前後有4個版本，在原作架構下衍生新的番外篇，未直接在遊戲中使用動畫故事。
「一開始由公視提供大綱、風格，以及第一集劇本。」負責遊戲企劃的哇哇科技產品經理姚筠潔表示，可參考的素材有限，最初遊戲腳本很難精確掌握故事核心及人物特色。後來公視提供較完整的劇本，接著她在遊戲內加入許多與動畫呼應的冒險、友情元素，希望玩家有更深刻的遊玩體驗。
